exemple.sim

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// reaction enzymatique: E catalyse s -> p
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species	E, s, Es, p;    // les 4 especes moleculaires, E, s, p et le complexe Es

diametre = 100;         // la vesicule est une sphere de 100 nm de diametre

size (E) = 10;          // l'enzyme fait 10 nm de diametre
speed (E) = 0.1;        // et diffuse a 0.1 fois la vitesse maximale

size (Es) = 10;         // pareil pour le complexe Es
speed (Es) = 0.1;

size (s) = 1;           // le substrat s fait 1 nm de diametre
speed (s) = 1;          // et diffuse a vitesse maximale

size (p) = 1;           // pareil pour le produit p
speed (p) = 1;

E + s -> Es [0.5];      // L'enzyme capture son substrat
Es    -> E + s [0.002]; // mais le relache...
Es    -> E + p [0.006]; // ou bien libere le produit

pop (E) = 30;           // 30 enzymes au depart
pop (s) = 1000;         // et 1000 substrats