Update dev docs

materialsvirtuallab · Mar 6, 2021 · 050227a · 050227a
1 parent 3218d88
commit 050227a
Show file tree

Hide file tree

Showing 142 changed files with 12,845 additions and 1,833 deletions.
diff --git a/docs/_modules/index.html b/docs/_modules/index.html
@@ -5,7 +5,7 @@
   <head>
     <meta charset="utf-8" />
     <meta name="viewport" content="width=device-width, initial-scale=1.0" />
-    <title>Overview: module code &#8212; pymatgen-diffusion 2020.10.8 documentation</title>
+    <title>Overview: module code &#8212; pymatgen-diffusion 2021.3.5 documentation</title>
     <link rel="stylesheet" href="../_static/pygments.css" type="text/css" />
     <link rel="stylesheet" href="../_static/flasky.css" type="text/css" />
     <script id="documentation_options" data-url_root="../" src="../_static/documentation_options.js"></script>
@@ -36,7 +36,7 @@ <h3>Navigation</h3>
         <li class="right" >
           <a href="../py-modindex.html" title="Python Module Index"
              >modules</a> |</li>
-        <li class="nav-item nav-item-0"><a href="../index.html">pymatgen-diffusion 2020.10.8 documentation</a> &#187;</li>
+        <li class="nav-item nav-item-0"><a href="../index.html">pymatgen-diffusion 2021.3.5 documentation</a> &#187;</li>
         <li class="nav-item nav-item-this"><a href="">Overview: module code</a></li> 
       </ul>
     </div>  
@@ -47,16 +47,24 @@ <h3>Navigation</h3>
           <div class="body" role="main">
 
   <h1>All modules for which code is available</h1>
-<ul><li><a href="pymatgen_diffusion/aimd/clustering.html">pymatgen_diffusion.aimd.clustering</a></li>
-<li><a href="pymatgen_diffusion/aimd/pathway.html">pymatgen_diffusion.aimd.pathway</a></li>
-<li><a href="pymatgen_diffusion/aimd/rdf.html">pymatgen_diffusion.aimd.rdf</a></li>
-<li><a href="pymatgen_diffusion/aimd/van_hove.html">pymatgen_diffusion.aimd.van_hove</a></li>
-<li><a href="pymatgen_diffusion/neb/full_path_mapper.html">pymatgen_diffusion.neb.full_path_mapper</a></li>
-<li><a href="pymatgen_diffusion/neb/io.html">pymatgen_diffusion.neb.io</a></li>
-<li><a href="pymatgen_diffusion/neb/pathfinder.html">pymatgen_diffusion.neb.pathfinder</a></li>
-<li><a href="pymatgen_diffusion/neb/periodic_dijkstra.html">pymatgen_diffusion.neb.periodic_dijkstra</a></li>
-<li><a href="pymatgen_diffusion/utils/parse_entries.html">pymatgen_diffusion.utils.parse_entries</a></li>
-<li><a href="pymatgen_diffusion/utils/supercells.html">pymatgen_diffusion.utils.supercells</a></li>
+<ul><li><a href="pymatgen/analysis/diffusion/aimd/clustering.html">pymatgen.analysis.diffusion.aimd.clustering</a></li>
+<li><a href="pymatgen/analysis/diffusion/aimd/pathway.html">pymatgen.analysis.diffusion.aimd.pathway</a></li>
+<li><a href="pymatgen/analysis/diffusion/aimd/rdf.html">pymatgen.analysis.diffusion.aimd.rdf</a></li>
+<li><a href="pymatgen/analysis/diffusion/aimd/tests/test_clustering.html">pymatgen.analysis.diffusion.aimd.tests.test_clustering</a></li>
+<li><a href="pymatgen/analysis/diffusion/aimd/tests/test_pathway.html">pymatgen.analysis.diffusion.aimd.tests.test_pathway</a></li>
+<li><a href="pymatgen/analysis/diffusion/aimd/tests/test_rdf.html">pymatgen.analysis.diffusion.aimd.tests.test_rdf</a></li>
+<li><a href="pymatgen/analysis/diffusion/aimd/tests/test_van_hove.html">pymatgen.analysis.diffusion.aimd.tests.test_van_hove</a></li>
+<li><a href="pymatgen/analysis/diffusion/aimd/van_hove.html">pymatgen.analysis.diffusion.aimd.van_hove</a></li>
+<li><a href="pymatgen/analysis/diffusion/neb/full_path_mapper.html">pymatgen.analysis.diffusion.neb.full_path_mapper</a></li>
+<li><a href="pymatgen/analysis/diffusion/neb/io.html">pymatgen.analysis.diffusion.neb.io</a></li>
+<li><a href="pymatgen/analysis/diffusion/neb/pathfinder.html">pymatgen.analysis.diffusion.neb.pathfinder</a></li>
+<li><a href="pymatgen/analysis/diffusion/neb/periodic_dijkstra.html">pymatgen.analysis.diffusion.neb.periodic_dijkstra</a></li>
+<li><a href="pymatgen/analysis/diffusion/neb/tests/test_full_path_mapper.html">pymatgen.analysis.diffusion.neb.tests.test_full_path_mapper</a></li>
+<li><a href="pymatgen/analysis/diffusion/neb/tests/test_io.html">pymatgen.analysis.diffusion.neb.tests.test_io</a></li>
+<li><a href="pymatgen/analysis/diffusion/neb/tests/test_pathfinder.html">pymatgen.analysis.diffusion.neb.tests.test_pathfinder</a></li>
+<li><a href="pymatgen/analysis/diffusion/utils/parse_entries.html">pymatgen.analysis.diffusion.utils.parse_entries</a></li>
+<li><a href="pymatgen/analysis/diffusion/utils/supercells.html">pymatgen.analysis.diffusion.utils.supercells</a></li>
+<li><a href="pymatgen/analysis/diffusion/utils/tests/test_parse_entries.html">pymatgen.analysis.diffusion.utils.tests.test_parse_entries</a></li>
 </ul>
 
             <div class="clearer"></div>